一、基礎信息
個人簡介🧑🏻🦱:陳磊🧔🏼♂️,男🗝,漢族,1982年1月生,上海南匯人👩🏿🏫,民盟盟員,博士研究生學歷,副教授,現任Journal of Medical Systems和Frontiers in Genetics副主編,Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening和Current Proteomics部門編輯🏃🏻♂️➡️,Current Bioinformatics和Current Gene Therapy編委會成員🧑🏼🍳。主要從事人工智能在生物醫學上的應用和算法理論方面的教學研究工作🫥,在設計算法處理和分析生物醫學數據方面取得了重要成果🤷,主持國家自然科學基金😇、上海市自然科學基金等項目🪒,發表多篇頂級期刊學術論文。2020-2022年連續三年入選愛思唯爾中國高被引學者及全球前2%頂尖科學家榜單。
(一)個人基礎信息
性別:陳磊
出生年月:1982年1月
職務👤:副教授
博碩導:碩士生導師
電子郵箱:lchen@shmtu.edu.cn
(二)教育經歷
於華東師範大學大學系統分析與集成專業🎅🏼,取得博士學位
(三)社會兼職
1. Journal of Medical Systems副主編
2. Frontiers in Genetics副主編
3. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening部門編輯
4. Current Proteomics部門編輯
5. Current Bioinformatics編委會成員
6. Current Gene Therapy編委會成員
二、科學研究
(一)研究領域及科研團隊
研究領域🧍♀️:生物醫學大數據處理及人工智能算法設計、生物信息學、算法設計與分析、圖論
(二)代表性論文成果
1. Lei Chen, Yuwei Chen, RMTLysPTM: Recognizing multiple types of lysine PTM sites by deep analysis on sequences, Briefings in Bioinformatics, 25(1)(2024), bbad450.
2. Lei Chen, Jing Xu, Yubin Zhou, PDATC-NCPMKL: Predicting drug’s Anatomical Therapeutic Chemical (ATC) codes based on network consistency projection and multiple kernel learning, Computers in Biology and Medicine, 169(2024), 107862.
3. Lei Chen, XiaoYong Pan, Wei Guo, Zijun Gan, Yu-Hang Zhang, Zhibin Niu, Tao Huang, Yu-Dong Cai, Investigating the gene expression profiles of cells in seven embryonic stages with machine learning algorithms, Genomics, 112(3)(2020), 2524-2534.
4. Lei Chen, XiaoYong Pan, Yu-Hang Zhang, Min Liu, Tao Huang, Yu-Dong Cai, Classification of widely and rarely expressed genes with recurrent neural network, Computational and Structural Biotechnology Journal, 17(2019), 49-60.
5. Lei Chen, Tao Liu, Xian Zhao, Inferring anatomical therapeutic chemical (ATC) class of drugs using shortest path and random walk with restart algorithms, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Basis of Disease, 1864(6, Part B)(2018), 2228-2240.
6. Lei Chen, Yu-Hang Zhang, Zhenghua Zhang, Tao Huang, Yu-Dong Cai, Inferring novel tumor suppressor genes with a protein-protein interaction network and network diffusion algorithms, Molecular Therapy - Methods & Clinical Development, 10(2018), 57-67.
7. Lei Chen, Yu-Hang Zhang, Guohui Lu, Tao Huang, Yu-Dong Cai, Analysis of cancer-related lncRNAs using gene ontology and KEGG pathways, Artificial Intelligence in Medicine, 76(2017), 27-36.
8. Lei Chen, Xiaoyong Pan, XiaoHua Hu, Yu-Hang Zhang, ShaoPeng Wang, Tao Huang, Yu-Dong Cai, Gene expression differences among different MSI statuses in colorectal cancer, International Journal of Cancer, 143(7)(2018), 1731-1740.
9. Lei Chen, Weiming Zeng, Changhong Lu, NP-completeness and APX-completeness of restrained domination in graphs, Theoretical Computer Science, 448(2012), 1-8.
10.Lei Chen, Changhong Lu, Zhenbing Zeng, Hardness results and approximation algorithms for (weighted) paired-domination in graphs, Theoretical Computer Science, 410(47-49)(2009), 5063-5071.
三🌛、教學信息
(一)授課信息
主講本科生課程🚵🏿:《離散數學》、《計算方法》
主講研究生課程:《矩陣分析與應用》
(二)指導學生獲獎情況
1. 2019年指導研究生參加中青杯全國大學生數學建模競賽獲二等獎
2. 2018年指導本科生參加亞太地區大學生數學建模競賽獲本科生組二等獎
四🚸、其它成果或榮譽
(一)其它榮譽
1. 愛思唯爾中國高被引學者⛹️♀️,愛思唯爾出版社👩❤️👨,2020、2021🧛🏼、2022年
2. 上海海事大學校劉浩清青年英才獎,校級👩🏻🦱,上海海事大學,2019年
3. 上海海事大學校優秀教育工作者,校級🦜,上海海事大學,2017年
4. 上海海事大學科技論文獎一等獎,校級😶,上海海事大學,2016年
5. 上海海事大學ESI高被引論文獎,校級🂠,上海海事大學🏝,2014年
6. 上海海事大學校優秀青年教師,校級🌸,上海海事大學,2013年
7. 上海市計算機學會優秀博士論文優勝獎,上海市計算機學會🐔,2012年
8. 上海市晨光學者🫵🏽,省部級⏸,上海市教育委員會、上海市教育發展基金會👻,2012年
9. 上海海事大學課題組科技獎(論文)🖲,校級,上海海事大學,2010年